在进行河蚌珍珠养殖时，科学施肥可以促进河蚌的生长，提高珍珠的质量。通常可以采用有机肥料或者专门的河蚌珍珠营养剂进行施肥，但要注意不要过量，否则会对河蚌的生长不利。珍珠河蚌的食物主要是单胞藻、原生动物和有机碎屑等，如轮虫、鞭毛虫、绿眼虫、绿粒藻、栅藻、舟形藻、甲藻、四角藻、纺锤硅藻、杆星藻、甲壳动物的残屑及植物叶片等，易被消化的主要是硅藻。
